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基于Adh1基因分析高粱属的系统进化关系
认领
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被引量:
4
1
作者
廖芳
刘勇
+2 位作者
杨秀丽
黄国明
牛春敬
《遗传》
CAS
北大核心
2009年第5期523-530,共8页
高梁属中有重要的粮食作物和优良牧草,也有农业生产上的重要杂草。文章旨在进一步从分子水平阐明高梁属种间的系统进化关系,为有效利用种质资源进行分子育种改良作物品质提供理论依据,并明确检疫性杂草的分类地位。根据二色高粱(Sorghum...
高梁属中有重要的粮食作物和优良牧草,也有农业生产上的重要杂草。文章旨在进一步从分子水平阐明高梁属种间的系统进化关系,为有效利用种质资源进行分子育种改良作物品质提供理论依据,并明确检疫性杂草的分类地位。根据二色高粱(Sorghum bicolor)的Adh1全基因序列(GenBank登录号:AF050456)设计引物,扩增并测定黑高粱(S.almum)、假高粱(S.halepense)、丝克高粱(S.silk)和苏丹草(S.sudanense)共计8个植物材料约2 000 bp的Adh1基因部分序列,结合GenBank中其他24个Sorghum属的同源序列,以Cleistachne sorghoides的对应序列为外群,进行了高梁属的亲缘关系分析,用MP、ML和NJ法分别构建了分子进化树,得到了基本相同的拓扑结构。结果显示:(1)高梁属可明显分为三大支,一支是蒴柄高梁(Chaetosorghum)和异高梁(Heterosorghum)二个亚属,一支是优高梁亚属(Eusorghum),这两个分支包含2n=20、40,染色体较小的种类,另一分支包括拟高梁(Parasorghum)和有柄高梁(Stiposorghum)两个亚属,包含2n=10的种类和它们的多倍体近缘种,染色体相对较大;(2)S.almum的Adh1基因表现出明显的地理分化;(3)Parasorghum亚属的S.pur-pureosericeum和多色高粱(S.versicolor)、光高粱(S.nitidum)和S.leiocladum聚在一起,而该亚属中的S.mata-rankense、S.grande、S.timorense却与亚属Stiposorghum的种聚在一起,表现出更近的亲缘关系;(4)S.mac-rospermum和S.laxiflorum之间具有比其他高梁属种更近的亲缘关系。
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关键词
高梁属
Adh1基因
分子进化树
亲缘关系
暂未订购
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用Rim2超级家族分子指纹鉴别杂交水稻及预测杂种优势
认领
引用
被引量:
8
2
作者
张礼霞
王林友
+3 位作者
张利华
何祖华
金庆生
王建军
《作物学报》
CAS
北大核心
2007年第1期77-83,共7页
选用5对Rim2引物对21份籼稻和20份粳稻材料进行了DNA指纹扩增,共扩增出38条谱带,其中多态性谱带26条,多态性水平为69.64%;粳稻平均多态性水平为56.67%,明显高于籼稻。根据Nei’s遗传距离计算获得的聚类树状图表明,参试21份籼稻材料聚为6...
选用5对Rim2引物对21份籼稻和20份粳稻材料进行了DNA指纹扩增,共扩增出38条谱带,其中多态性谱带26条,多态性水平为69.64%;粳稻平均多态性水平为56.67%,明显高于籼稻。根据Nei’s遗传距离计算获得的聚类树状图表明,参试21份籼稻材料聚为6组,20份粳稻材料聚为7组。亲缘关系分析表明,Rim2分子指纹可以区分多数的籼稻或粳稻材料,且显示出材料的遗传特征。考察部分籼稻和粳稻杂交组合的产量对照优势与双亲间遗传距离的关系,发现杂交粳稻的遗传距离与杂交优势表现出相关性,而杂交籼稻无此相关性。
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关键词
水稻
Rim2分子指纹
聚类树状图
杂种优势
暂未订购
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基于PG蛋白的蔷薇科植物分子进化树的构建与分析
认领
引用
被引量:
3
3
作者
李芳菲
马文瑶
+1 位作者
金亮亮
杨英军
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第19期6332-6340,共9页
为了分析蔷薇科植物PG蛋白序列的进化关系,从NCBI网站搜索到177条相关蔷薇科植物PG蛋白序列,筛选出23条可用序列,采用ClustalW2和MEGA6两种聚类方法联配,并构建分子进化树。结果表明:蔷薇科植物23条PG序列聚类成2个类群,一类群有14条序...
为了分析蔷薇科植物PG蛋白序列的进化关系,从NCBI网站搜索到177条相关蔷薇科植物PG蛋白序列,筛选出23条可用序列,采用ClustalW2和MEGA6两种聚类方法联配,并构建分子进化树。结果表明:蔷薇科植物23条PG序列聚类成2个类群,一类群有14条序列,主要为苹果亚科梨属和苹果属植物;另一类群包括8条序列,为李亚科的桃属和杏属植物。ClustalW2和MEGA6两种方法的分析结果基本一致,表明两种方法都可用于评价蔷薇科植物的演化与进化关系。本研究通过对23条蔷薇科植物PG序列的亲缘关系的分析,为蔷薇科植物在基因工程育种方面提供了理论依据。
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关键词
蔷薇科
多聚半乳糖醛酸酶
分子进化树
亲缘关系
暂未订购
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题名
基于Adh1基因分析高粱属的系统进化关系
认领
引用
被引量:
4
1
作者
廖芳
刘勇
杨秀丽
黄国明
牛春敬
机构
天津出入境检验检疫局
南开大学生命科学学院
出处
《遗传》
CAS
北大核心
2009年第5期523-530,共8页
基金
国家十一五科技支撑计划项目(编号:2006BAK10B06)资助
摘要
高梁属中有重要的粮食作物和优良牧草,也有农业生产上的重要杂草。文章旨在进一步从分子水平阐明高梁属种间的系统进化关系,为有效利用种质资源进行分子育种改良作物品质提供理论依据,并明确检疫性杂草的分类地位。根据二色高粱(Sorghum bicolor)的Adh1全基因序列(GenBank登录号:AF050456)设计引物,扩增并测定黑高粱(S.almum)、假高粱(S.halepense)、丝克高粱(S.silk)和苏丹草(S.sudanense)共计8个植物材料约2 000 bp的Adh1基因部分序列,结合GenBank中其他24个Sorghum属的同源序列,以Cleistachne sorghoides的对应序列为外群,进行了高梁属的亲缘关系分析,用MP、ML和NJ法分别构建了分子进化树,得到了基本相同的拓扑结构。结果显示:(1)高梁属可明显分为三大支,一支是蒴柄高梁(Chaetosorghum)和异高梁(Heterosorghum)二个亚属,一支是优高梁亚属(Eusorghum),这两个分支包含2n=20、40,染色体较小的种类,另一分支包括拟高梁(Parasorghum)和有柄高梁(Stiposorghum)两个亚属,包含2n=10的种类和它们的多倍体近缘种,染色体相对较大;(2)S.almum的Adh1基因表现出明显的地理分化;(3)Parasorghum亚属的S.pur-pureosericeum和多色高粱(S.versicolor)、光高粱(S.nitidum)和S.leiocladum聚在一起,而该亚属中的S.mata-rankense、S.grande、S.timorense却与亚属Stiposorghum的种聚在一起,表现出更近的亲缘关系;(4)S.mac-rospermum和S.laxiflorum之间具有比其他高梁属种更近的亲缘关系。
关键词
高梁属
Adh1基因
分子进化树
亲缘关系
Keywords
genus Sorghum
Adh1 gene
molecular dendrogram
phylogenetic relationship
分类号
S514 [农业科学—作物学]
暂未订购
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题名
用Rim2超级家族分子指纹鉴别杂交水稻及预测杂种优势
认领
引用
被引量:
8
2
作者
张礼霞
王林友
张利华
何祖华
金庆生
王建军
机构
浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所
中国科学院上海生命科学院植物生理生态研究所
出处
《作物学报》
CAS
北大核心
2007年第1期77-83,共7页
基金
国家自然科学基金项目(30571061)
浙江省自然科学基金项目(Y304156
+1 种基金
Y305660)
浙江省政府"8812"计划项目(2004C12020-1-2)
摘要
选用5对Rim2引物对21份籼稻和20份粳稻材料进行了DNA指纹扩增,共扩增出38条谱带,其中多态性谱带26条,多态性水平为69.64%;粳稻平均多态性水平为56.67%,明显高于籼稻。根据Nei’s遗传距离计算获得的聚类树状图表明,参试21份籼稻材料聚为6组,20份粳稻材料聚为7组。亲缘关系分析表明,Rim2分子指纹可以区分多数的籼稻或粳稻材料,且显示出材料的遗传特征。考察部分籼稻和粳稻杂交组合的产量对照优势与双亲间遗传距离的关系,发现杂交粳稻的遗传距离与杂交优势表现出相关性,而杂交籼稻无此相关性。
关键词
水稻
Rim2分子指纹
聚类树状图
杂种优势
Keywords
Oryza sativa L.
Rim2
molecular
fingerprint
Dendrogram
Heterosis
分类号
S511 [农业科学—作物学]
暂未订购
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题名
基于PG蛋白的蔷薇科植物分子进化树的构建与分析
认领
引用
被引量:
3
3
作者
李芳菲
马文瑶
金亮亮
杨英军
机构
河南科技大学林学院
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第19期6332-6340,共9页
基金
河南省教育厅重点项目(13A210873)
洛阳市科技发展计划项目(1402011A)共同资助
摘要
为了分析蔷薇科植物PG蛋白序列的进化关系,从NCBI网站搜索到177条相关蔷薇科植物PG蛋白序列,筛选出23条可用序列,采用ClustalW2和MEGA6两种聚类方法联配,并构建分子进化树。结果表明:蔷薇科植物23条PG序列聚类成2个类群,一类群有14条序列,主要为苹果亚科梨属和苹果属植物;另一类群包括8条序列,为李亚科的桃属和杏属植物。ClustalW2和MEGA6两种方法的分析结果基本一致,表明两种方法都可用于评价蔷薇科植物的演化与进化关系。本研究通过对23条蔷薇科植物PG序列的亲缘关系的分析,为蔷薇科植物在基因工程育种方面提供了理论依据。
关键词
蔷薇科
多聚半乳糖醛酸酶
分子进化树
亲缘关系
Keywords
Rosaceae
Polygalacturonase
Molecular dendrogram
Phylogenetic relationship
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
暂未订购
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于Adh1基因分析高粱属的系统进化关系
廖芳
刘勇
杨秀丽
黄国明
牛春敬
《遗传》
CAS
北大核心
2009
4
暂未订购
下载PDF
2
用Rim2超级家族分子指纹鉴别杂交水稻及预测杂种优势
张礼霞
王林友
张利华
何祖华
金庆生
王建军
《作物学报》
CAS
北大核心
2007
8
暂未订购
下载PDF
3
基于PG蛋白的蔷薇科植物分子进化树的构建与分析
李芳菲
马文瑶
金亮亮
杨英军
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2018
3
暂未订购
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