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Fractal Geometry of a Dendrogram 认领 引用 被引量：1
1
作者 Francisco Casanova-del-Angel 《Journal of Mathematics and System Science》 2014年第1期14-18,共5页
The fractal structure shown by the poligonal created by unions of middle points of vertices, nodes or peaks of dendograms terminal classes is presented. Its generating fractal, the details of its construction, and the... The fractal structure shown by the poligonal created by unions of middle points of vertices, nodes or peaks of dendograms terminal classes is presented. Its generating fractal, the details of its construction, and the way to measure its segments are defined; its property of inverted scale, the type of meshing, its property of axial symmetry and a theorem on transformation of linear affinity are considered. This is exemplified by means of one application with real data. 展开更多
关键词 Dendrogram fractal axial symmetry engenderer.
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EFFECTIVE AUTOMATED NEGOTIATION BASED ON ISSUE DENDROGRAMS AND PARTIAL AGREEMENTS 认领 引用 被引量：2
2
作者 ShinjiKakimoto Katsuhide Fujita 《Journal of Systems Science and Systems Engineering》 SCIE EI CSCD 2018年第2期201-214,共14页
Negotiation is both an important topic in multi-agent systems research and an important aspect of daily life. Many real-world negotiations are complex and involve multiple interdependent issues, therefore, there has b... Negotiation is both an important topic in multi-agent systems research and an important aspect of daily life. Many real-world negotiations are complex and involve multiple interdependent issues, therefore, there has been increasing interest in such negotiations. Existing nonlinear automated negotiation protocols have difficulty in finding solutions when the number of issues and agents is large. In automated negotiations covering multiple independent issues, it is useful to separate out the issues and reach separate agreements on each in turn. In this paper, we propose an effective approach to automated negotiations based on recursive partitioning using an issue dendrogram. A mediator first finds partial agreements in each sub-space based on bids from the agents, then combines them to produce the final agreement. When it cannot find a solution, our proposed method recursively decomposes the negotiation sub-problems using an issue dendrogram. In addition, it can improve the quality of agreements by considering previously-found partial consensuses. We also demonstrate experimentally that our protocol generates higher-optimality outcomes with greater scalability than previous methods. 展开更多
关键词 Multi-issue negotiation issue dendrogram partial agreement
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A novel method for clustering cellular data to improve classification 认领 引用
3
作者 Diek W.Wheeler Giorgio A.Ascoli 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2025年第9期2697-2705,共9页
Many fields,such as neuroscience,are experiencing the vast prolife ration of cellular data,underscoring the need fo r organizing and interpreting large datasets.A popular approach partitions data into manageable subse... Many fields,such as neuroscience,are experiencing the vast prolife ration of cellular data,underscoring the need fo r organizing and interpreting large datasets.A popular approach partitions data into manageable subsets via hierarchical clustering,but objective methods to determine the appropriate classification granularity are missing.We recently introduced a technique to systematically identify when to stop subdividing clusters based on the fundamental principle that cells must differ more between than within clusters.Here we present the corresponding protocol to classify cellular datasets by combining datadriven unsupervised hierarchical clustering with statistical testing.These general-purpose functions are applicable to any cellular dataset that can be organized as two-dimensional matrices of numerical values,including molecula r,physiological,and anatomical datasets.We demonstrate the protocol using cellular data from the Janelia MouseLight project to chara cterize morphological aspects of neurons. 展开更多
关键词 cellular data clustering dendrogram data classification Levene's one-tailed statistical test unsupervised hierarchical clustering
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Genetic Diversity of Tuberose(Polianthes tuberosa L.)Germplasm through Molecular Approaches to Obtain Desirable Plant Materials for Future Breeding Programs 认领 引用
4
作者 Vardhelli Soukya Soumen Maitra +9 位作者 Nandita Sahana Saikat Das Rupsanatan Mandal Arpita Mandal Khan Arindam Das Ashok Choudhury Prodyut Kumar Paul Ahmed Gaber Mohammed M.Althaqafi Akbar Hossain 《Phyton-International Journal of Experimental Botany》 SCIE 2025年第11期3493-3508,共16页
The present study investigated the genetic diversity of 24 germplasms of Polianthes tuberosa L.via 16 inter simple sequence repeat(ISSR)marker techniques.The research findings revealed that the ISSR markers presented ... The present study investigated the genetic diversity of 24 germplasms of Polianthes tuberosa L.via 16 inter simple sequence repeat(ISSR)marker techniques.The research findings revealed that the ISSR markers presented higher levels of band reproducibility andweremore efficient at clustering germplasms.Among the 16markers examined in this study,12 had a complete polymorphism rate of 100%.Themolecular analysis revealed a PICranging from0.079 to 0.373,with amean value of 0.30,whereas the range of themarker index was from0.0001 to 0.409,with an average value of 0.03,and the primer resolving power ranged from 0.173 to 4.173,with a mean value of 2.02.The UPGMA clustering dendrogram indicated that all 24 germplasms were grouped into three main clusters.The study revealed a variable range of tree distances between 0.185 and 0.621,with the highest tree distance(0.621)detected between germplasms BR-24 and BR-1.Through these studies,the dissimilarity among the germplasms was evaluated,and diverse parents were identified for further crop improvement programs. 展开更多
关键词 Dendrogram genetic diversity inter simple sequence repeats polymorphism tuberose
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ASUN:一种基于最大最近邻比率的任意形状层次聚类方法 认领 引用
5
作者 郑爱宇 《计算机时代》 2025年第10期31-37,43,共7页
传统层次聚类算法虽然能够输出完整的树状图,但通常无法有效识别任意形状的类簇;而现有大多数针对任意形状类簇的层次聚类算法基于重构的类簇结构,往往依赖更复杂的概念和参数,且难以输出完整树状图。本文提出一种单一参数的基于最大最... 传统层次聚类算法虽然能够输出完整的树状图,但通常无法有效识别任意形状的类簇;而现有大多数针对任意形状类簇的层次聚类算法基于重构的类簇结构,往往依赖更复杂的概念和参数,且难以输出完整树状图。本文提出一种单一参数的基于最大最近邻比率的任意形状层次聚类算法ASUN,该算法既能保证任意形状类簇的聚类精度,又能输出高质量树状图。首先,我们定义了基于类簇间k-最近邻对关系(kNNP)的相似性度量,kNNP关系表征类簇局部边界的内在关联性,该相似性度量能最大化两个类簇局部边界的聚合程度;其次,详细阐述了ASUN算法的实现流程以及其优化版本f-ASUN;最后,通过在合成数据集和真实数据集上与同类算法的对比实验,验证了所提算法的有效性和高效性。 展开更多
关键词 任意形状类簇 树状图 局部边界 最大最近邻比率 单一参数
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Characterization of a collection of Chinese fir elite genotypes using sequence.related amplified polymorphism markers 认领 引用 被引量：3
6
作者 Hongjing Duan Dehuo Hu +1 位作者 Yun Li Huiquan Zheng 《Journal of Forestry Research》 SCIE CAS CSCD 2016年第5期1105-1110,共6页
Chinese fir [Cunninghamia lanceolata （Lamb.） Hook] is a major timber tree species in China. In the pre- sent study, sequence-related amplified polymorphism （SRAP） markers were used to evaluate the polymorphisms, d... Chinese fir [Cunninghamia lanceolata （Lamb.） Hook] is a major timber tree species in China. In the pre- sent study, sequence-related amplified polymorphism （SRAP） markers were used to evaluate the polymorphisms, diversity, and relationships in a collection of Chinese fir elite genotypes （n = 103） from the Lechang provenance, an endangered provenance. Thirty-five SRAP primer combinations produced 620 bands among the tested 103 Lechang provenance genotypes and 17 nonSLechang provenance genotypes; 577 （93.1%） of these were polymorphic, yielding an average of 16.5 polymorphic bands per primer combination. Of the SRAP primer combinations （n = 35）, I4 ones identified 〉70.0 % of the 120 genotypes. The Mel2-Eml9 combination had the strongest discriminatory ability with 93.3 % of the genotypes iden- tified. An UPGMA dendrogram further showed that most of the Lechang provenance genotypes （87.4 %） grouped together （Cluster A）. The Lechang genotypes had a con- siderable amount of genetic variation with genetic simi- larity from 0.40 to 0.81. The current work may facilitate the management of the endangered Lechang Chinese fir provenance. 展开更多
关键词 Chinese fir SRAP Germplasm Geneticvariation - Dendrogram
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Polymorphic information and genetic diversity in Brassica speciesrevealed by RAPD markers 认领 引用
7
作者 ALI RAZA ABU BAKR UMER FAROOQ +4 位作者 WAQAR AHMAD KHAN AHSAN IQBAL SADETTINÇELİK MAHWISH ALI RAO SOHAIL AHMAD KHAN 《BIOCELL》 SCIE 2020年第4期769-776,共8页
Randomly amplified polymorphic DNA(RAPD)is a tremendously convenient approach used to discriminate between Brassica species owing to its accuracy and speed.RAPD primers generate adequate genetic information that can b... Randomly amplified polymorphic DNA(RAPD)is a tremendously convenient approach used to discriminate between Brassica species owing to its accuracy and speed.RAPD primers generate adequate genetic information that can be used in the primer-marker system.In this work,twenty RAPD-PCR based markers were executed to generate polymorphic data,like polymorphic information content(PIC),mean resolving power(MRP),resolving power(RP),effective multiplex ratio(EMR),and marker index(MI)for the first time and genetic distance among and between six Brassica species were calculated.Our results indicated that 20 primers produced a total of 231 scored band and generated 87%polymorphic bands.Average PIC,MRP,RP,MI,and EMR values were 0.088,0.65,6.7,0.78,and 8.9,respectively.PIC showed an overall negative correlation with MRP,RP,MI,and EMR,whereas MRP,RP,and EMR,were positively correlated with each other.Genetic identities ranged from 41.99%(between Brassica napus and Brassica oleracea)to 68.83%(between Brassica campestris and Brassica oleracea).Dendrogram results showed no clustering between species except between Brassica campestris and Brassica nigra.Nevertheless,these results will be helpful to acquire useful information about the markers and their use to determine the genomic structures of Brassica species.Further,based on genetic distance and polymorphic information,new hybrids can be developed for effective oilseed production. 展开更多
关键词 Brassica Dendrogram DNA markers Genetic distance Gel electrophoresis Polymorphism
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面向大规模定制的产品模块化设计方法 认领 引用 被引量：50
8
作者 王海军 孙宝元 +1 位作者 王吉军 魏小鹏 《计算机集成制造系统》 EI 北大核心 2004年第10期1171-1176,共6页
对零件进行了功能和物理特性分析 ,得到了零件之间的交互值并形成了关系矩阵 ,采用层次分析法对影响模块形成的因素进行了权重分配 ;基于模糊树图方法对产品模块进行了合理、有效的划分 ,并应用基于多专家的综合评判法对取不同阈值的模... 对零件进行了功能和物理特性分析 ,得到了零件之间的交互值并形成了关系矩阵 ,采用层次分析法对影响模块形成的因素进行了权重分配 ;基于模糊树图方法对产品模块进行了合理、有效的划分 ,并应用基于多专家的综合评判法对取不同阈值的模块划分结果进行方案评价 ;结合典型实例说明了该文提出的设计方法可以解决面向大规模定制的产品模块化形成问题。与其他优化算法相比 ,基于模糊树图理论的模块形成方法可以对产品进行有效、合理的模块划分 ,具有良好的适应性和通用性 ;基于多专家的模糊综合评判方法可以对模块的划分方案进行科学的决策 。 展开更多
关键词 模块化 大规模定制 模糊树图 综合评判
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苹果栽培品种的SSR鉴定及遗传多样性分析 认领 引用 被引量：18
9
作者 高华 樊红科 +3 位作者 万怡震 王雷存 赵政阳 王西平 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期153-158,共6页
应用SSR技术对40个苹果栽培品种进行遗传多样性分析,12对SSR引物扩增出114个等位基因,平均每个位点9.5个,位点杂合度为0.237 8~0.682 7,遗传多样性指数为0.534 4。用3对引物（Hi01c11、Hi03d06和GD162）可将供试的40个品种完全区分开。... 应用SSR技术对40个苹果栽培品种进行遗传多样性分析,12对SSR引物扩增出114个等位基因,平均每个位点9.5个,位点杂合度为0.237 8~0.682 7,遗传多样性指数为0.534 4。用3对引物（Hi01c11、Hi03d06和GD162）可将供试的40个品种完全区分开。聚类分析结果显示,40个苹果品种的相似系数的变化范围为0.705~0.982,表现出较高的遗传多样性。供试品种在相似系数0.862处被分为5大类群,与品种的系谱来源基本吻合。 展开更多
关键词 苹果 SSR 遗传多样性 聚类分析
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中国红花遗传多样性的AFLP分子标记(英文) 认领 引用 被引量：41
10
作者 张磊 黄蓓蓓 +1 位作者 开国银 郭美丽 《药学学报》 CAS 北大核心 2006年第1期91-96,共6页
目的考察红花的种内变异，为进一步进行红花种质资源选育和筛选品质相关基因奠定基础。方法采用扩增片段长度多态性（AFLP）技术，研究中国红花28个不同栽培居群在DNA水平的多态性。采用UPGMA构建系统树图进行聚类分析和计算遗传距离。... 目的考察红花的种内变异，为进一步进行红花种质资源选育和筛选品质相关基因奠定基础。方法采用扩增片段长度多态性（AFLP）技术，研究中国红花28个不同栽培居群在DNA水平的多态性。采用UPGMA构建系统树图进行聚类分析和计算遗传距离。结果筛选得到的12对引物的扩增片段具有丰富的多态性。各居群间的遗传相似系数在0．48-0．96。聚类分析显示它们分为3大主要类群和一个中间类群。结论红花种内存在一定的遗传多样性。基于AFLP条带统计的聚类结果和表型特征并不完全一致，可能是基因型和环境共同作用于表型的结果。 展开更多
关键词 扩增片段长度多态性 中国红花 系统树图 遗传多样性
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中国灌木辣椒种质遗传多样性的SRAP和SSR分析 认领 引用 被引量：23
11
作者 陈学军 周坤华 +1 位作者 宗洪霞 方荣 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第11期2201-2205,共5页
应用SRAP和SSR分子标记对8份辣椒种质进行了遗传多样性分析,结果表明,15对SRAP引物组合共扩增出321条带,平均每对引物扩增出21.40条,多态性位点比率为72.90%;18对SSR引物共扩增出109条带,平均每对引物扩增出6.06条,多态性位点比率为98.... 应用SRAP和SSR分子标记对8份辣椒种质进行了遗传多样性分析,结果表明,15对SRAP引物组合共扩增出321条带,平均每对引物扩增出21.40条,多态性位点比率为72.90%;18对SSR引物共扩增出109条带,平均每对引物扩增出6.06条,多态性位点比率为98.17%。与SRAP比较,SSR检测到的Shannon多样性指数(I)、观测等位基因数(Na)和有效等位基因数(Ne)等遗传多样性参数都较大,说明SSR有更高的多态性检测效率。基于SRAP的聚类与基于SSR的聚类之间存在极显著正相关,且都能将中国灌木辣椒种质与美洲灌木辣椒种质及一年生辣椒种质有效区分。 展开更多
关键词 灌木辣椒 遗传多样性 SRAP SSR 聚类分析
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陕西省急性弛缓性麻痹病例中柯萨奇病毒A组4型的基因特征 认领 引用 被引量：16
12
作者 王东艳 徐艺 +7 位作者 张勇 祝双利 司源 严冬梅 朱晖 杨倩 冀天娇 许文波 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期145-149,共5页
阐明从陕西省2006~2010年急性弛缓性麻痹（Acute Flaccid Paralysis,AFP）病例中分离的柯萨奇病毒A组4型（Coxsackievirus A4,CV-A4）VP1编码区的基因特征,探索其在我国流行的优势基因型及其与AFP病例之间的关系。本研究通过逆转录-聚... 阐明从陕西省2006~2010年急性弛缓性麻痹（Acute Flaccid Paralysis,AFP）病例中分离的柯萨奇病毒A组4型（Coxsackievirus A4,CV-A4）VP1编码区的基因特征,探索其在我国流行的优势基因型及其与AFP病例之间的关系。本研究通过逆转录-聚合酶链反应（Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR）对连续5年从AFP病例中分离的68株非脊灰肠道病毒（non-polio enteroviruses,NPEVs）进行分子定型,其中7株鉴定为CV-A4（7/68,10.3%）;使用特异性引物扩增CV-A4VP1编码区并进行核苷酸序列测定分析和基因进化分析,将CV-A4划分为A（基因组1）、B（基因组2）和C三个基因型,其中C基因型又划分为C1（基因组3）和C2（基因组4）两个基因亚型。中国分离的CV-A4均位于第4基因组,属于C2基因亚型,提示其可能为中国大陆CV-A4的优势基因亚型;7株陕西CV-A4毒株依据分离年代的不同位于不同的三个小进化分支里,且和来自山东和吉林两省的邻近年份的CV-A4毒株位于同一小分支,提示7株陕西CV-A4分离株和它们存在共同进化和共循环。在无脊髓灰质炎时代应进一步加强监测CV-A4在AFP病例NPEV所占的比例和动态变化。 展开更多
关键词 急性弛缓性麻痹病例 柯萨奇病毒A组4型 亲缘关系进化树 优势基因型
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云南地方辣椒品种涮辣和雀辣的植物学分类 认领 引用 被引量：14
13
作者 顾晓振 郑宇峰 +4 位作者 张正海 曹亚从 张宝玺 李锡香 王立浩 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期809-814,共6页
涮辣和雀辣是我国云南地区有特色的两个地方品种。本文分别基于园艺性状和90份不同类型的辣椒资源利用均匀覆盖12条染色体的29个SSR标记进行聚类分析。研究结果表明,园艺性状以及分子水平上涮辣归属于中国辣椒(C.chinese),雀辣更倾向归... 涮辣和雀辣是我国云南地区有特色的两个地方品种。本文分别基于园艺性状和90份不同类型的辣椒资源利用均匀覆盖12条染色体的29个SSR标记进行聚类分析。研究结果表明,园艺性状以及分子水平上涮辣归属于中国辣椒(C.chinese),雀辣更倾向归属于灌木辣椒(C.frutescens)。 展开更多
关键词 植物学分类 园艺性状 遗传结构 进化树
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面向设计的产品模块划分方法 认领 引用 被引量：17
14
作者 王日君 张进生 +1 位作者 葛培琪 王志 《农业机械学报》 EI CAS 北大核心 2009年第9期182-186,共5页
提出了面向产品设计的模块划分方法。首先对产品子结构间的功能和结构相关性进行了分析,应用模糊树图聚类算法,探讨了模块的聚类形成过程,得到多种模块划分方案。然后,基于信息熵理论,以模块化产品设计中的横系列设计复杂度、纵系列设... 提出了面向产品设计的模块划分方法。首先对产品子结构间的功能和结构相关性进行了分析,应用模糊树图聚类算法,探讨了模块的聚类形成过程,得到多种模块划分方案。然后,基于信息熵理论,以模块化产品设计中的横系列设计复杂度、纵系列设计复杂度和更新换代设计复杂度为优化目标,建立了面向设计的模块划分方案数学评价模型,对模糊树图法聚类得到的多个方案进行评价,从而得到最合理的模块划分方案。最后,以石材花线制品加工设备为例,验证了该方法的有效性和合理性。 展开更多
关键词 模块化设计 模块划分 模糊树图 复杂度
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5个重庆地方猪种遗传多样性的微卫星分析 认领 引用 被引量：13
15
作者 白小青 范首君 +10 位作者 王金勇 刘文 郭宗义 何道领 陈四清 王可甜 付文贵 陈磊 赵久刚 蓝静 张亮 《畜牧兽医学报》 CAS 北大核心 2010年第12期1515-1522,共8页
为了分析5个重庆地方猪种的遗传多样性和系统发生关系,采用FAO-ISAG联合推荐的27个微卫星标记,以有效等位基因数、期望杂合度和多态信息含量等遗传参数为指标,评估了品种内遗传变异。计算了F统计量、Nei氏遗传距离(DA)和Nei氏标准遗传距... 为了分析5个重庆地方猪种的遗传多样性和系统发生关系,采用FAO-ISAG联合推荐的27个微卫星标记,以有效等位基因数、期望杂合度和多态信息含量等遗传参数为指标,评估了品种内遗传变异。计算了F统计量、Nei氏遗传距离(DA)和Nei氏标准遗传距离(DS)并进行UPGMA和NJ聚类分析及主成分分析,进而探讨了品种间的遗传分化和亲缘关系。结果,27个微卫星座位共检测到542个等位基因,其中43个等位基因为单一品种所特有。5个猪种的遗传多样性丰富:有效等位基因数(Ne)在9.4933～11.0280之间,期望杂合度(He)在0.8897～0.9091之间,多态信息含量(PIC)在0.8689～0.8926之间。F统计量分析表明,重庆地方猪种遗传分化明显(P0.05)。该研究结果为重庆地方猪种的保护和利用提供了重要的理论依据。 展开更多
关键词 地方猪种 遗传多样性 微卫星标记 遗传距离 聚类分析
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中国斗鸡遗传分化的微卫星标记分析 认领 引用 被引量：18
16
作者 汤青萍 陈宽维 +2 位作者 李慧芳 章双杰 赵东伟 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 北大核心 2005年第3期19-23,28,共5页
　利用27个微卫星位点对中国斗鸡(河南斗鸡、鲁西斗鸡、吐鲁番斗鸡、西双版纳斗鸡及漳州斗鸡)进行了遗传检测,统计了其群体杂合度、多态信息含量、有效等位基因数及品种间的遗传距离,并进行了系统聚类分析。结果表明,西双版纳斗鸡群体... 　利用27个微卫星位点对中国斗鸡(河南斗鸡、鲁西斗鸡、吐鲁番斗鸡、西双版纳斗鸡及漳州斗鸡)进行了遗传检测,统计了其群体杂合度、多态信息含量、有效等位基因数及品种间的遗传距离,并进行了系统聚类分析。结果表明,西双版纳斗鸡群体杂合度最高,为0.662,具有丰富的遗传多样性;河南斗鸡群体杂合度较低,为0.532,说明河南斗鸡基因型趋于一致。漳州斗鸡与吐鲁番斗鸡遗传距离最远,为0.516;鲁西斗鸡与西双版纳斗鸡遗传距离最近,为0.206。聚类结果表明,西双版纳斗鸡与吐鲁番斗鸡均为鲁西斗鸡的后裔,三者之间距离较近,而漳州斗鸡则与河南斗鸡、鲁西斗鸡、吐鲁番斗鸡及西双版纳斗鸡的遗传距离较远。 展开更多
关键词 微卫星 中国斗鸡 遗传分化 系统聚类分析
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面向设计的产品模块划分方法 认领 引用 被引量：11
17
作者 王日君 张进生 +1 位作者 葛培琪 王志 《武汉理工大学学报》 CAS 北大核心 2010年第1期174-178,共5页
提出了面向产品设计的模块划分方法。首先对产品子结构间的功能和结构相关性进行了分析,应用模糊树图聚类算法,探讨了模块的聚类形成过程,得到多种模块划分方案。然后,基于信息熵理论,以模块化产品设计中的横系列设计复杂度、纵系列设... 提出了面向产品设计的模块划分方法。首先对产品子结构间的功能和结构相关性进行了分析,应用模糊树图聚类算法,探讨了模块的聚类形成过程,得到多种模块划分方案。然后,基于信息熵理论,以模块化产品设计中的横系列设计复杂度、纵系列设计复杂度和更新换代设计复杂度为优化目标,建立了面向设计的模块划分方案数学评价模型,对模糊树图法聚类得到的多个方案进行评价,从而得到最合理的模块划分方案。最后,以石材花线制品加工设备为例,验证了该方法的有效性和合理性。 展开更多
关键词 模块化设计 模块划分 模糊树图 复杂度
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新疆南疆地区4个地方绵羊品种微卫星标记的遗传多样性分析 认领 引用 被引量：9
18
作者 赵冰茹 毋状元 +6 位作者 董红 霍飞 陈童 罗永明 王岳强 季斐 郑新宝 《家畜生态学报》 北大核心 2020年第10期29-34,共6页
该研究利用联合国粮食及农业组织(FAO)和国际动物遗传学会(ISAG)推荐的9个微卫星引物,结合荧光标记PCR对新疆南疆地区4个地方绵羊(Ovis aries)品种的遗传多样性进行研究,为中国地方绵羊品种资源保护和种质创新提供参考。结果表明:共检测... 该研究利用联合国粮食及农业组织(FAO)和国际动物遗传学会(ISAG)推荐的9个微卫星引物,结合荧光标记PCR对新疆南疆地区4个地方绵羊(Ovis aries)品种的遗传多样性进行研究,为中国地方绵羊品种资源保护和种质创新提供参考。结果表明:共检测到136个等位基因,平均有效等位基因数在5.20~6.03之间,以等位基因为基础,得出群体平均杂合度在0.7146~0.8573之间,座位的平均杂合度在0.7497~0.8600之间。对各微卫星标记进行F-统计分析,Fst的变化范围从MCM140的0.0222到BM1314的0.0545;基因流平均值为6.4686。9个微卫星座位均呈现高度多态,表明新疆南疆地区4个地方绵羊品种有着丰富的遗传多样性。遗传距离表明柯尔克孜羊和巴音布鲁克羊的距离最远,多浪羊和巴尔楚克羊的距离最近。聚类分析表明多浪羊群体单独聚为一类,巴尔楚克羊和柯尔克孜羊聚为一类,这与品种起源、育成历史及地理分布基本一致。研究结果提示,新疆南疆地区绵羊遗传多样性较为丰富,保护与利用价值较高,这些信息可为新疆现有地方绵羊品种类型的划分和品种资源遗传多样性的保护和利用提供科学依据。 展开更多
关键词 绵羊 微卫星 遗传多样性 遗传距离 聚类关系
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用Rim2超级家族分子指纹鉴别杂交水稻及预测杂种优势 认领 引用 被引量：8
19
作者 张礼霞 王林友 +3 位作者 张利华 何祖华 金庆生 王建军 《作物学报》 CAS 北大核心 2007年第1期77-83,共7页
选用5对Rim2引物对21份籼稻和20份粳稻材料进行了DNA指纹扩增,共扩增出38条谱带,其中多态性谱带26条,多态性水平为69.64%;粳稻平均多态性水平为56.67%,明显高于籼稻。根据Nei’s遗传距离计算获得的聚类树状图表明,参试21份籼稻材料聚为6... 选用5对Rim2引物对21份籼稻和20份粳稻材料进行了DNA指纹扩增,共扩增出38条谱带,其中多态性谱带26条,多态性水平为69.64%;粳稻平均多态性水平为56.67%,明显高于籼稻。根据Nei’s遗传距离计算获得的聚类树状图表明,参试21份籼稻材料聚为6组,20份粳稻材料聚为7组。亲缘关系分析表明,Rim2分子指纹可以区分多数的籼稻或粳稻材料,且显示出材料的遗传特征。考察部分籼稻和粳稻杂交组合的产量对照优势与双亲间遗传距离的关系,发现杂交粳稻的遗传距离与杂交优势表现出相关性,而杂交籼稻无此相关性。 展开更多
关键词 水稻 Rim2分子指纹 聚类树状图 杂种优势
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16种平菇遗传关系的SRAP分析 认领 引用 被引量：6
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作者 常艳 金青 +3 位作者 凌磊 蔡永萍 聂凡 林毅 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期834-838,共5页
为了确定不同来源的平菇遗传差异,利用相关序列扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)分子标记技术,对安徽地区的16个平菇品种的遗传多样性进行了分析。筛选出24对随机引物组合,获得了627条清晰条带,平均每对引物产... 为了确定不同来源的平菇遗传差异,利用相关序列扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)分子标记技术,对安徽地区的16个平菇品种的遗传多样性进行了分析。筛选出24对随机引物组合,获得了627条清晰条带,平均每对引物产生26.1条。多态性条带共189条,占总条带数的30.1%,平均每对引物组合得到7.88条多态性条带。依据SRAP标记聚类,在遗传相似系数0.65的水平上,供试的16个平菇品种分为2个大类:Ⅰ和Ⅱ。Ⅰ类分为2个亚类:A类和B类,Ⅱ类也分为2个亚类:C类和D类。其中A类和D类各包括4个品种,B类中有3个品种,C类中有5个品种,从而在DNA水平上证明了所研究的平菇种质资源的遗传多样性。 展开更多
关键词 平菇 遗传关系 SRAP 聚类分析
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