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基于网络药理学和16S rRNA测序探讨黄连解毒汤治疗2型糖尿病的作用机制 认领 引用 被引量：1
1
作者 韩雪 唐秋梅 +3 位作者 王巍 杨光勇 田维毅 何光志 《海南医科大学学报》 CAS 北大核心 2026年第12期936-946,共11页
目的:通过网络药理学和16S rRNA测序方法研究黄连解毒汤治疗2型糖尿病的作用机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选黄连解毒汤的活性成分及靶点,将所获得靶点导入蛋白质数据库(UniProt)查找对应基因名;在人类基因组... 目的:通过网络药理学和16S rRNA测序方法研究黄连解毒汤治疗2型糖尿病的作用机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选黄连解毒汤的活性成分及靶点,将所获得靶点导入蛋白质数据库(UniProt)查找对应基因名;在人类基因组数据库(GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、TTD数据库收集疾病靶点;通过韦恩图得到药物和疾病的交集靶点,并利用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物成分-疾病靶点”网络以确定关键活性成分;通过STRING数据库进行蛋白与蛋白相互作用(PPI)分析,利用Cytoscape 3.7.2软件中插件功能筛选关键靶点;然后通过Metascape数据库进行KEGG富集分析并构建“药物成分-疾病靶点-信号通路”网络以确定关键信号通路;最后通过H&E染色和16S rRNA测序方法对网络药理学结果进行实验验证。结果:通过网络药理学方法分析,得到黄连解毒汤共有85种活性成分及对应靶点236个,疾病靶点1 549个;两者交集靶点133个,所对应活性成分62个;黄连解毒汤的关键活性成分为槲皮素、汉黄芩素等,PPI网络分析主要包括蛋白激酶B1(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL-6)等核心靶点且与磷酸肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信号通路密切相关。通过动物实验发现,与正常组相比,模型组大鼠结肠组织结构异常,腺体萎缩且排列紊乱,部分腺体间距增宽,杯状细胞明显减少;黄连解毒汤干预后结肠组织结构明显改善,腺体排列整齐,可见大量杯状细胞。并且黄连解毒汤能够影响肠道菌群丰富度和多样性,在门水平上增加厚壁菌门(Firmicutes)丰度,降低拟杆菌门(Bacteroidetes)丰度,在属水平上增加乳酸杆菌属(Lactobacillus)、异芽孢杆菌属(Allobaculum)和布劳特氏菌属(Blautia)等有益菌丰度;LEfSe分析发现异芽孢杆菌属(Allobaculum)、乳酸球菌属(Lactococcus)和布劳特氏菌属(Blautia)是黄连解毒汤治疗2型糖尿病的差异性标志物。结论:黄连解毒汤能够促进有益菌增殖,减轻肠道炎症反应,修复肠屏障来治疗2型糖尿病。 展开更多
关键词 黄连解毒汤 2型糖尿病 网络药理学 16S rRNA测序
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基于16S rRNA测序与随机森林模型的上海市公共浴池水细菌群落特征及其与嗜肺军团菌污染的关联 认领 引用
2
作者 石丽莎 陈健 +2 位作者 李晓静 郑毅鸣 张莉君 《环境与职业医学》 CAS CSCD 北大核心 2026年第1期82-88,107,共7页
[背景]公共浴池嗜肺军团菌污染问题是近年来受关注的公共卫生问题之一,其与水样细菌群落特征的关联性研究有限,16S rRNA测序技术与随机森林模型为解析该关联性及公共浴池水细菌群落特征提供了新途径。[目的]掌握上海市公共浴池水细菌群... [背景]公共浴池嗜肺军团菌污染问题是近年来受关注的公共卫生问题之一,其与水样细菌群落特征的关联性研究有限,16S rRNA测序技术与随机森林模型为解析该关联性及公共浴池水细菌群落特征提供了新途径。[目的]掌握上海市公共浴池水细菌群落结构及多样性,探究嗜肺军团菌污染与细菌群落特征的关联性,并筛选关联性关键菌属,为制定公共浴池水卫生管理规范提供科学依据。[方法]于2023年2—3月期间,依据公共沐浴场所经营规模、区域分布、不同功能情况,选取上海市10家公共浴池水为研究对象,检测其水质卫生状况。根据嗜肺军团菌检测结果,将样本分为军团菌检出组和未检出组,采用16S rRNA测序分析水样的细菌群落结构、α-多样性和β-多样性,利用冗余分析(RDA)探究理化指标与细菌群落多样性的关联性,并通过随机森林模型筛选区分两组的关键菌属,以平均精度下降值(MDA)评估菌属重要性。[结果]军团菌检出组耗氧量小于军团菌未检出组(均值分别为1.85 mg·L-1vs.6.81 mg·L-1,P0.05)。RDA分析表明,细菌群落多样性与水质pH呈正相关,与耗氧量和游离性余氯呈负相关,其中RDA1和RDA2对细菌群落多样性的解释率分别为23.92%和21.30%。利用随机森林模型筛选出对军团菌检出组和未检出组水样中微生物群落分布差异有较大影响的有慢生根瘤菌科未分类属(MDA=2.42)、亚栖热菌属(MDA=2.37)、黄杆菌属(MDA=2.26)等20种关键菌属。[结论]公共浴池水细菌群落多样性受到pH值、耗氧量和游离性余氯影响,嗜肺军团菌污染水样细菌群落更丰富,且存在引起群落差异的特征性关键细菌属,机器学习随机森林技术有助于探索特征性关键细菌属,研究结果为开展该类场所风险预警提供了依据。 展开更多
关键词 公共浴池水 16S rRNA测序 随机森林模型 群落结构 多样性 嗜肺军团菌
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16S rRNA测序分析饮用含氯水对大鼠和小鼠肠道菌群的影响差异 认领 引用
3
作者 艾秀峰 张利棕 +4 位作者 方明笋 吕东颖 陈楚 蔡兆伟 王德军 《实验动物与比较医学》 CAS 2026年第3期437-445,共9页
目的评估饮用含氯水对大鼠、小鼠肠道菌群的影响,探讨模式动物肠道微生态对含氯饮用水中氯刺激的响应差异。方法6只8周龄雄性SD大鼠与6只8周龄雄性C57BL/6小鼠,适应性喂养5 d后,将大鼠和小鼠的饮用水由纯水换为含25.4~32.4 nmol/L游离... 目的评估饮用含氯水对大鼠、小鼠肠道菌群的影响,探讨模式动物肠道微生态对含氯饮用水中氯刺激的响应差异。方法6只8周龄雄性SD大鼠与6只8周龄雄性C57BL/6小鼠,适应性喂养5 d后,将大鼠和小鼠的饮用水由纯水换为含25.4~32.4 nmol/L游离氯的水,持续干预8周,实验期间饲喂相同的饲料。分别于干预前(第0周,作为对照组)和第3周、第8周的最后一天(作为饮用含氯水组)收集粪便样本,通过16S rRNA测序分析菌群组成,并进行α多样性(Chao1和Shannon指数)、β多样性[主成分分析(principal component analysis,PCA)]及线性判别分析效应量(linear discriminant analysis effect size,LEfSe)分析。结果干预3周后,饮用含氯水组大鼠和小鼠肠道菌群的α多样性均显著低于对照组(P4.0],菌群多样性的降幅更大,差异菌属的数量更多。结论饮用含氯水可改变大鼠、小鼠肠道菌群的多样性及结构,且小鼠对此更为敏感,提示在动物实验饮水管理及模型选择中,应关注氯对肠道微生态的潜在影响。 展开更多
关键词 16S rRNA测序 肠道菌群 含氯水 纯化水 SD大鼠 C57BL/6J小鼠
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基于16S rRNA测序与非靶向代谢组学探究光甘草定抗结直肠癌作用 认领 引用
4
作者 吴颖 王成磊 +5 位作者 陈雪 杨冰炜 翟浩宇 崔慕瑶 吴佳禾 李卫东 《辽宁中医药大学学报》 CAS 2026年第5期17-25,F0003,共9页
目的通过构建MC38荷瘤小鼠模型,结合16S rRNA高通量测序和非靶向代谢组学技术,检测光甘草定(glabridin,Gla)对小鼠肠道菌群及代谢物的影响,探究其对结直肠癌(colorectal cancer,CRC)的抗肿瘤作用。方法将24只6周龄C57BL/6雄性小鼠随机... 目的通过构建MC38荷瘤小鼠模型,结合16S rRNA高通量测序和非靶向代谢组学技术,检测光甘草定(glabridin,Gla)对小鼠肠道菌群及代谢物的影响,探究其对结直肠癌(colorectal cancer,CRC)的抗肿瘤作用。方法将24只6周龄C57BL/6雄性小鼠随机分为空白组、模型组、5-氟尿嘧啶组和光甘草定组,每组6只。空白组与模型组腹腔注射100μL 0.9%氯化钠溶液,光甘草定组腹腔注射100μL光甘草定溶液(50 mg/kg),连续给药7 d后每2 d给药1次。观察小鼠一般情况,第22天取材。测量各组肿瘤质量,HE染色观察肿瘤组织变化,免疫组化(IHC)染色检测肿瘤组织Ki-67、Cyclin D1、Cleaved Caspase-3表达,16S rRNA检测肠道菌群结构的变化,非靶向代谢检测代谢物差异。结果Gla能显著抑制小鼠肿瘤的生长;HE染色发现Gla干预后小鼠肿瘤组织排列密度降低,核小浅染,可见显著凋亡区域;IHC染色发现Gla干预后肿瘤组织中Ki-67、Cyclin D1表达下调,Cleaved Caspase-3表达上调(P<0.01);16S rRNA测序结果显示Gla能改变小鼠肠道菌群结构,优势菌属丰度显著改变;非靶向代谢组学共筛选出51种差异代谢物,富集分析得到萜类骨架生物合成、谷胱甘肽代谢、过氧化物酶体增殖物激活受体、HIF-1信号通路、赖氨酸降解、GABAergic synapse、糖酵解/糖异生、胆固醇代谢、烟酸和烟酰胺代谢9条潜在通路。结论Gla可通过改善肠道菌群多样性,调控肠道微生态平衡和肠道代谢产物,抑制CRC的进展。 展开更多
关键词 光甘草定 结直肠癌 肠道菌群 代谢组学 16S rRNA测序
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基于16S rRNA测序与非靶向代谢组解析饲喂亚麻籽与裂殖壶藻对牦牛瘤胃微生物群及脂肪酸代谢的影响 认领 引用
5
作者 漆政君 王国文 +3 位作者 付长其 舒适 沈秀英 张君 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2026年第3期1435-1457,共23页
旨在通过对牦牛饲喂亚麻籽(Linum usitatissimum)与裂殖壶藻(Schizochytrium),分析其对瘤胃微生物和肉质脂肪酸的影响。本研究选用21头12月龄的雄性健康牦牛,体重在(95.00±5.20)kg,按照试验要求分为3组,每组重复7只,补饲组(S)作为... 旨在通过对牦牛饲喂亚麻籽(Linum usitatissimum)与裂殖壶藻(Schizochytrium),分析其对瘤胃微生物和肉质脂肪酸的影响。本研究选用21头12月龄的雄性健康牦牛,体重在(95.00±5.20)kg,按照试验要求分为3组,每组重复7只,补饲组(S)作为对照组,2组试验组分别饲喂亚麻籽(Y)和裂殖壶藻(L),试验时间为210 d,结合16S rRNA测序和非靶向代谢组,解析其对舍饲牦牛瘤胃微生物群落结构以及差异代谢物的影响。结果显示,饲喂亚麻籽和裂殖壶藻显著影响牦牛生长性能、肌肉脂肪酸组成及瘤胃微生物。两处理组干物质采食量显著降低(P<0.05),但料重比显著下降(P<0.05)。裂殖壶藻组肌肉二十二碳六烯酸(DHA)含量显著提高(0.35%vs补饲组0.04%,P<0.05),n-6-3比值降低(5.42 vs补饲组36.28);亚麻籽组总脂肪酸含量显著增加(1.44 g vs补饲组0.85 g,P<0.05)。瘤胃微生物分析显示,亚麻籽组厚壁菌门丰度显著升高(69%vs补饲组57%,P<0.05),拟杆菌门显著降低(21%vs补饲组27%,P<0.05),裂殖壶藻组普雷沃菌属显著增加(7.5%vs补饲组3.9%,P<0.05)。α多样性显示处理组菌群多样性低于补饲组,β多样性3组之间差异显著。肌肉代谢组分析表明,两处理组下调磷脂类和酰基肉碱代谢(P<0.05),上调脂肪酸衍生物。相关性分析显示瘤胃菌群与肌肉代谢显著关联(如候选菌门与丁二酸代谢正相关,P<0.05)。亚麻籽和裂殖壶藻通过影响瘤胃微生物及肌肉代谢促进牦牛脂质沉积。本研究为高寒地区牦牛舍饲方法提供了理论与技术支撑。 展开更多
关键词 牦牛 瘤胃微生物 亚麻籽 裂殖壶藻 16S rRNA测序 非靶向代谢组学
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基于16S rRNA测序的抗生素治疗对反复种植失败合并慢性子宫内膜炎患者妊娠结局的影响 认领 引用
6
作者 许美含 何陈佳 +1 位作者 吴娴 徐步芳 《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2026年第2期172-180,共9页
目的·比较宫腔镜检查后给予广谱抗生素与16S rRNA基因测序并针对性给予抗生素联合补充乳杆菌对于反复种植失败(recurrent implantation failure,RIF)合并慢性子宫内膜炎(chronic endometritis,CE)患者妊娠结局的影响。方法·... 目的·比较宫腔镜检查后给予广谱抗生素与16S rRNA基因测序并针对性给予抗生素联合补充乳杆菌对于反复种植失败(recurrent implantation failure,RIF)合并慢性子宫内膜炎(chronic endometritis,CE)患者妊娠结局的影响。方法·回顾性分析2023年1月至2025年5月在上海交通大学医学院附属瑞金医院妇产科生殖医学中心就诊的676名排除已知因素(未行胚胎植入前非整倍体遗传学检测)的RIF患者(接受分泌中期16S rRNA测序或增殖期宫腔镜检查)的妊娠结局。27名患者16S rRNA检查结果提示乳杆菌占比0.05)。多因素Logistic回归分析结果显示,宫腔镜组与更低的活产率相关(OR=0.230,95%CI 0.087~0.607,P=0.003)。此外,女方高龄、体质量指数(body mass index,BMI)增加、仅移植1个胚胎以及移植卵裂胚均与更低的活产率相关(均P<0.05)。结论·与宫腔镜诊断联合广谱抗生素治疗相比,基于16S rRNA测序的菌群检测及针对性抗生素治疗联合补充乳杆菌可更有效改善RIF合并CE患者的妊娠结局,并且未发现对于母胎安全的不良影响。 展开更多
关键词 慢性子宫内膜炎 体外受精-胚胎移植 反复种植失败 16S rRNA测序 宫腔镜 乳杆菌补充治疗
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基于16S rRNA测序对小鼠坐骨神经损伤后的肠道菌群分析 认领 引用
7
作者 顾希 顾丹丹 +3 位作者 夏一鸣 蒋陶然 姚登兵 蒋茂荣 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 北大核心 2026年第1期23-33,共11页
目的通过构建小鼠坐骨神经横断模型,利用16S rRNA测序研究坐骨神经损伤对肠道菌群的影响。方法将18只C57BL/6小鼠随机分组,分别为假手术组、实验组(D1组、D4组、D7组、D14组、D28组)。造模时,假手术组仅开皮暴露神经取肠道内容物,其余... 目的通过构建小鼠坐骨神经横断模型,利用16S rRNA测序研究坐骨神经损伤对肠道菌群的影响。方法将18只C57BL/6小鼠随机分组,分别为假手术组、实验组(D1组、D4组、D7组、D14组、D28组)。造模时,假手术组仅开皮暴露神经取肠道内容物,其余在造模后第1、4、7、14、28天收集小鼠结肠内容物进行16S rRNA测序,分析肠道菌群的物种丰度变化和菌群基因功能预测。结果术后第4天开始,肠道内微生物群落的物种丰富度及多样性明显下降,第7天时物种水平开始回升。厚壁菌门(Firmicutes)、疣微菌门(Verrucomicrobiota)、变形菌门(Proteobacteria)的变化趋势明显,其中且以阿克曼氏菌属(Akkermansia)、库特氏菌属(Kurthia)、杜博西氏菌属(Dubosiella)等细菌表现最为显著。与假手术组相比,实验组Akkermansia水平逐渐下降;Kurthia、Dubosiella等水平于第4天开始上升,且第7天达到峰值。另外,根据菌群基因功能预测结果推断:多种代谢通路(如脂质代谢、氨基酸代谢等)在小鼠神经横断后可能受影响。结论坐骨神经横断引发小鼠肠道微生物菌群发生显著变化且通过基因功能预测观察到代谢相关通路的变化,提示微生物潜在功能可能受到影响。该结果需通过代谢组学进行验证,以期将来为探索肠道菌群在周围神经损伤修复中的潜在作用提供研究线索。 展开更多
关键词 坐骨神经横断 肠道菌群 16S rRNA测序 小鼠
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基于16S rRNA测序探讨不同糖尿病足危险程度与皮肤菌群的相关性研究 认领 引用
8
作者 赵曼鹭 杨奔奔 +4 位作者 朱秋瑾 李昌露 上官怡涵 陈霞 蔡玉兰 《中国全科医学》 CAS 北大核心 2026年第21期3004-3011,共8页
背景糖尿病足(DF)是糖尿病患者常见且严重的慢性并发症之一,具有高发病率、高致残率和高复发率等特点,严重影响了患者的生活质量。近年来研究发现,皮肤微生态失衡可能在DF的发生中发挥重要作用。目的采用16S rRNA测序技术,分析不同DF危... 背景糖尿病足(DF)是糖尿病患者常见且严重的慢性并发症之一,具有高发病率、高致残率和高复发率等特点,严重影响了患者的生活质量。近年来研究发现,皮肤微生态失衡可能在DF的发生中发挥重要作用。目的采用16S rRNA测序技术,分析不同DF危险程度患者足底皮肤菌群组成差异,探讨菌群失衡与DF发生风险之间的关系,为DF的早期预警和干预提供微生态依据。方法纳入2023年6月—2024年3月在遵义医科大学第二附属医院就诊的糖尿病患者64例及健康成年人16例,依据国际糖尿病足工作组(IWGDF)分级标准,将研究对象分为5组:对照组(16例)、极低风险组(VL组,16例)、低风险组(L组,15例)、中等风险组(M组,16例)及高风险组(H组,17例)。采集患者足底皮肤试纸样本,提取DNA,对16S rRNA基因V3~V4区扩增并通过Illumina Miseq平台进行高通量测序。使用Qiime 2软件进行OTU聚类和注释,结合线性判别分析效应量(LEfSe)及Metastats检验方法分析菌群差异。结果5组DF不同危险程度患者的足部皮肤菌群α多样性(Chao1、ACE、Shannon及Simpson指数)比较,差异均有统计学意义(P<0.001)。基于Bray-Curtis距离的主坐标分析(PCoA)显示,菌群结构在不同组间明显分离(P=0.001)。随着DF危险程度的升高,VL组、L组、M组及H组拟杆菌门和变形菌门丰度依次较前一个较低风险组增加,厚壁菌门和放线菌门丰度依次较前一个低风险组减少(P<0.001)。属水平上,VL组、L组、M组及H组棒状杆菌属、链球菌属、拟杆菌属丰度依次较前一个较低风险组增加,而葡萄球菌属丰度依次较前一个较低风险组减少(P<0.001)。LEfSe分析显示VL、L、M、H组的标志菌分别为栖水菌属、拟杆菌属、加德纳菌属和棒状杆菌属(P<0.05)。结论糖尿病患者足底皮肤菌群组成与DF危险程度密切相关。随着危险程度增加,菌群α多样性明显升高,菌群结构明显分离。DF高危患者表现出拟杆菌门、变形菌门及拟杆菌属等革兰氏阴性菌丰度升高,厚壁菌门、放线菌门及葡萄球菌属等革兰氏阳性菌明显减少,而低危患者则表现出相反的菌群变化,反映出明显的菌群失衡。不同DF危险程度患者足底具有特异性标志菌,提示菌群特征可作为DF风险评估与干预的潜在靶点。 展开更多
关键词 糖尿病足 菌群 16S rRNA测序 危险程度
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基于代谢组学和16S rRNA测序探究罗布麻叶总黄酮抗高脂血症的作用 认领 引用
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作者 许俊雅 许泽恭 +6 位作者 陈凯然 李敏晶 陈颖楠 苏美曦 洪筠 李卓芳 张蕾 《南京中医药大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2026年第6期882-895,共14页
目的探究罗布麻叶总黄酮(TFA)的抗高脂血症(HLP)作用,并阐明其对肠道菌群组成及代谢功能的调节作用。方法通过高脂饲料喂养建立HLP大鼠模型。造模同时分别给予阳性药辛伐他汀和不同剂量的TFA进行干预。末次给药后禁食,麻醉状态下腹主动... 目的探究罗布麻叶总黄酮(TFA)的抗高脂血症(HLP)作用,并阐明其对肠道菌群组成及代谢功能的调节作用。方法通过高脂饲料喂养建立HLP大鼠模型。造模同时分别给予阳性药辛伐他汀和不同剂量的TFA进行干预。末次给药后禁食,麻醉状态下腹主动脉取血,测定各组大鼠血清中甘油三酯(TG)、总胆固醇(TC)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、一氧化氮(NO)、超氧化物歧化酶(SOD)和丙二醛(MDA)水平;采用ELISA法测定血清血管紧张素Ⅱ(Ang-Ⅱ)、血管细胞黏附分子-1(VCAM-1)水平。采用非靶向代谢组学技术分析血清代谢物的差异,并使用16S rRNA测序检测肠道菌群结构的变化。将TFA降血脂的药理药效指标、肠道差异菌属与TFA所调控的差异代谢物进行相关性分析,进一步挖掘TFA所调控的代谢通路与其发挥药效和调控肠道菌群作用之间的关联。结果TFA能有效降低模型大鼠肝脏和血清中的TG、TC和LDL-C,升高HDL-C,且能显著降低血清LDL-C/HDL-C与动脉硬化指数(AI)。此外,TFA能显著升高血清NO和SOD含量,降低Ang-Ⅱ、VCAM-1和MDA水平。代谢组学分析表明,TFA能改善模型大鼠的血清代谢紊乱,主要调控甘油磷脂代谢、泛酸和辅酶A(CoA)生物合成等通路。肠道菌群分析结果表明,TFA可降低厚壁菌门/拟杆菌门(F/B)的比值,同时抑制变形菌门与放线菌门的异常增殖。结论TFA可以改善HLP大鼠脂质代谢、增强机体抗氧化能力、抑制自由基引起的脂质过氧化、对血管内皮具有一定保护作用,其作用机制可能与调控机体代谢及肠道菌群平衡相关。 展开更多
关键词 罗布麻叶 高脂血症 代谢组学 肠道菌群 16S rRNA测序 相关性分析 脂质代谢
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基于16S rRNA测序技术探究高脂血症急性胰腺炎与口腔菌群关系 认领 引用
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作者 张建 麦刚 《国际检验医学杂志》 CAS 2026年第14期1665-1671,1681,共7页
目的探讨高脂血症性急性胰腺炎(HLAP)与口腔微生物之间的关系并描述菌群的分布。方法选择2024年德阳市人民医院收治的HLAP患者104例为研究对象。根据患者诊断分为轻度HLAP组(A组,49例)、中-重度HLAP组(B组,55例),同期选择40例健康志愿... 目的探讨高脂血症性急性胰腺炎(HLAP)与口腔微生物之间的关系并描述菌群的分布。方法选择2024年德阳市人民医院收治的HLAP患者104例为研究对象。根据患者诊断分为轻度HLAP组(A组,49例)、中-重度HLAP组(B组,55例),同期选择40例健康志愿者为健康对照组(H组)。通过16S rRNA测序技术对样品进行处理,生成原始数据文件。对这些数据进行拼接、过滤及降噪,得到扩增子序列变异(ASVs)。通过α多样性分析、β多样性分析等生物信息学分析,评估微生物群落的特征和差异。结果该研究共获得7678个ASVs,其中A组4350个,B组4054个,H组976个。统计分析显示,该研究样本量充分,测序样本覆盖度高,组间群落结构差异大于组内差异,口腔唾液菌群结构的差异有统计学意义(P<0.05)。3类人群的口腔微生物群落在主要菌门的组成上表现出相似性,但其唾液微生物群落的组成差异有统计学意义(P<0.05)。与健康志愿者比较,HLAP患者厚壁菌门、拟杆菌门比例明显上升(P<0.05),而变形菌门、梭杆菌门、巴氏杆菌门、放线菌门比例明显降低(P<0.05)。属水平分析结果表明,HLAP患者卟啉单胞菌、异基因普氏菌和普氏菌的相对丰度较高(P<0.05),而奈瑟菌的相对丰度较低(P<0.05)。LEfSe分析显示,中-重度HLAP患者口腔微生物中拟杆菌门、拟杆菌纲、拟杆菌目和普氏菌科的丰度明显升高(P<0.05),而奈瑟菌属、奈瑟菌科和伯克氏菌目的丰度明显降低(P<0.05)。结论HLAP的发生与口腔唾液微生物群的失调密切相关,HLAP患者与健康志愿者相比口腔微生物群落组成成分相似,但落构成差异较大,在厚壁菌门、拟杆菌门、卟啉单胞菌、异基因普氏菌、普氏菌上相对丰度较高,相对丰度较低的包括变形菌门、梭杆菌门、巴氏杆菌门、放线菌门和奈瑟菌。 展开更多
关键词 高脂血症 急性胰腺炎 口腔微生物 16S rRNA测序 唾液
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岩藻多糖改善结肠炎相关性结直肠癌小鼠肠道菌群的16S rRNA测序研究 认领 引用
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作者 叶泓钰 阳成乾 +1 位作者 张文洁 徐艳霞 《临床医学进展》 2026年第3期3523-3534,共12页
目的:基于16S rRNA测序系统评估岩藻多糖(fucoidan, FU)对AOM/DSS诱导结肠炎相关性结直肠癌(colitis-associated colorectal cancer, CAC)小鼠肠道菌群多样性、组成及功能潜能的影响,为其改善肠道微生态失衡提供证据。方法:C57BL/6J小... 目的:基于16S rRNA测序系统评估岩藻多糖(fucoidan, FU)对AOM/DSS诱导结肠炎相关性结直肠癌(colitis-associated colorectal cancer, CAC)小鼠肠道菌群多样性、组成及功能潜能的影响,为其改善肠道微生态失衡提供证据。方法:C57BL/6J小鼠建立AOM/DSS诱导CAC模型,分为NC组、AOM/DSS组、FU低剂量组(FL, 600 mg/kg)和FU高剂量组(FH, 1200 mg/kg)。采集结肠内容物提取微生物DNA并进行16S rRNA高通量测序。分析α多样性(Chao1, Observed_species, Faith_pd, Shannon, Simpson, Pielou_e)、β多样性(Bray-Curtis, Jaccard, weighted/unweighted UniFrac, PCoA/NMDS)、属水平菌群组成与差异菌群(LEfSe),并采用PICRUSt2预测功能谱,结合metagenomeSeq进行差异通路分析。结果:α多样性分析显示,丰富度相关指标在组间差异不显著,而AOM/DSS组的多样性/均匀度指标发生显著改变,提示模型诱导菌群生态结构异常重排;FU干预后相关指标呈一定程度的调整趋势。β多样性分析显示,AOM/DSS组与NC组菌群结构明显分离,FU干预后FL与FH组样本在排序空间中发生位移并呈更集中聚类趋势,提示FU可重塑CAC背景下菌群群落结构。属水平分析与热图结果显示,FU干预可重构优势菌属谱系并形成剂量相关的菌群特征;LEfSe进一步筛选出不同组别的特征菌群标志物。功能预测提示各组以代谢相关模块为主,FU干预可影响整体功能谱结构;差异通路分析显示AOM/DSS相对NC存在多条代谢/转运相关通路异常改变。结论:岩藻多糖可在CAC模型背景下调节肠道菌群多样性与群落结构,重塑特征菌群组成,并影响预测功能与代谢相关通路,提示其改善CAC微生态失衡可能是其发挥保护作用的重要机制之一。 展开更多
关键词 岩藻多糖 结肠炎相关性结直肠癌 肠道菌群 16S rRNA测序 多样性分析 功能预测
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基于16S rRNA测序的刚毛棉鼠肠道菌群特征研究 认领 引用
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作者 董浩 冯曦 +7 位作者 杨纪礼扬 高强 陈磊 董青花 巩薇 梁春南 付瑞 左琴 《实验动物科学》 2026年第2期1-6,共6页
目的研究刚毛棉鼠的肠道菌群特征,促进该实验动物资源的开放共享。方法采集10只刚毛棉鼠的盲肠、结肠和直肠内容物样品,利用16S rRNA通用引物扩增V3-V4区域并进行高通量测序。通过QIIME软件分析各组样品的菌群组成和α/β多样性指标,采... 目的研究刚毛棉鼠的肠道菌群特征,促进该实验动物资源的开放共享。方法采集10只刚毛棉鼠的盲肠、结肠和直肠内容物样品,利用16S rRNA通用引物扩增V3-V4区域并进行高通量测序。通过QIIME软件分析各组样品的菌群组成和α/β多样性指标,采用LEfSe方法筛选具有统计学差异的菌群标志物。结果从10只刚毛棉鼠的样本中共获得2359297条16S rRNA有效序列。在门的水平上,厚壁菌门、拟杆菌门和疣微菌门在各组样品中都是相对丰度前三的优势菌。α多样性分析结果显示,Observed Features、Chao1、Shannon、Simpson、Good’s Coverage等5项指标在3组样品中均无显著性差异;β多样性分析结果显示,盲肠内容物与结肠内容物样品之间存在显著组间差异(P<0.05);LEfSe分析结果表明,在脱硫杆菌门(Desulfobacterota)、Desulfovibrionia纲、脱硫弧菌目(Desulfovibrionales)、脱硫弧菌科(Desulfovibrionaceae)、脱硫弧菌属(Desulfovibrio)、厚壁菌门(Firmicutes)、梭菌纲(Clostridia)、毛螺菌目(Lachnospirales)、毛螺菌科(Lachnospiraceae)、颤螺菌目(Oscillospirales)和颤螺菌科(Oscillospiraceae)的细菌为刚毛棉鼠的盲肠内容物中显著性差异的菌群标志物;拟杆菌门(Bacteroidota)、拟杆菌纲(Bacteroidia)、拟杆菌目(Bacteroidales)、Muribaculaceae科的细菌为直肠内容物的肠道菌群内显著性差异的菌群标志物。结论本研究利用16S rRNA高通量测序技术,系统分析了刚毛棉鼠部分肠段内容物中的肠道菌群组成与丰度特征,为后续开展相关研究提供了基础数据支撑。 展开更多
关键词 刚毛棉鼠 肠道菌群 16S rRNA高通量测序
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基于16S rRNA测序和粪菌移植法探讨穿山龙总皂苷对高尿酸血症小鼠肠道菌群的影响 认领 引用 被引量：3
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作者 高澳 王晓菲 +5 位作者 卢意 卢柠霞 王天雨 卢芳 于栋华 刘树民 《中成药》 CAS CSCD 北大核心 2025年第2期634-641,共8页
目的基于16S rRNA测序和粪菌移植法(FMT)探讨穿山龙总皂苷对高尿酸血症小鼠肠道菌群的影响。方法大鼠随机分为空白组、模型组、穿山龙总皂苷组及别嘌醇组,除空白组外,其他3组灌胃给予5%氧嗪酸钾混悬液,连续5周,并给予10%酵母饲料;第3周... 目的基于16S rRNA测序和粪菌移植法(FMT)探讨穿山龙总皂苷对高尿酸血症小鼠肠道菌群的影响。方法大鼠随机分为空白组、模型组、穿山龙总皂苷组及别嘌醇组,除空白组外,其他3组灌胃给予5%氧嗪酸钾混悬液,连续5周,并给予10%酵母饲料;第3周,穿山龙总皂苷组及别嘌醇组分别灌胃给予480 mg/kg穿山龙总皂苷及25 mg/kg别嘌醇,第5周采用全自动生化分析仪检测血清尿酸、尿素氮水平。建立伪无菌小鼠模型,分为空白对照组、正常粪便移植组、模型粪便移植组、穿山龙总皂苷粪便移植组,后三者分别灌胃给予空白组、模型组、穿山龙总皂苷组大鼠粪菌悬液,连续5周,对新鲜粪便进行16S rRNA测序,全自动生化分析仪检测血清尿酸、尿素氮水平。结果经过粪菌移植给药穿山龙总皂苷后,与模型粪便移植组比较,穿山龙总皂苷粪便移植组尿酸水平及拟杆菌属、毛螺菌属丰度降低(P<0.05),弯曲菌门、螺杆菌属、梭菌属丰度升高(P<0.05)。结论穿山龙总皂苷可通过调控高尿酸血症小鼠的肠道菌群动态平衡,影响其组成与功能,从而降低血尿酸。 展开更多
关键词 穿山龙总皂苷 高尿酸血症 粪菌移植 16S rRNA测序 肠道菌群
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基于16S rRNA测序的上海市某三甲医院集中空调通风系统细菌群落的分布特征 认领 引用 被引量：2
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作者 倪骏 张海云 +5 位作者 陈健 张莉君 刘永萍 李晓静 郑毅鸣 张莉萍 《环境与职业医学》 CAS CSCD 北大核心 2025年第6期732-739,共8页
[背景]医院是各类患者与易感人群聚集的场所,呼吸道传染病的病原微生物是造成医疗机构呼吸道传染病交叉感染的重要原因。集中空调通风系统在改善室内环境的同时,更加剧了呼吸道传染病的传播风险。[目的]了解医院集中空调通风系统(后称... [背景]医院是各类患者与易感人群聚集的场所,呼吸道传染病的病原微生物是造成医疗机构呼吸道传染病交叉感染的重要原因。集中空调通风系统在改善室内环境的同时,更加剧了呼吸道传染病的传播风险。[目的]了解医院集中空调通风系统(后称“集中空调”)微生物分布特征,为医院集中空调卫生标准中微生物指标的选择和医院的风险预警提供科学依据。[方法]2023年10月,选取上海市某三甲医院2套集中空调通风系统,其中一套集中空调为全空气空调系统,服务于一层候诊区,另一套集中空调为风机盘管加新风系统,服务于三层门诊区。对通风系统中风口、过滤网、表冷器和冷凝水盘4个不同部位的样本进行细菌群落的16S rRNA测序,采用α多样性分析和β多样性分析,了解医院集中空调通风系统微生物群落组成及多样性特征。通过功能分析,了解集中空调通风系统细菌功能相对丰度。[结果]共检测到操作分类单元(OTUs)528个,涵盖了20个细菌门、37个纲、79个目、123个科和240个属。分析结果显示,细菌群落的组成以变形菌门、芽单胞菌门、拟杆菌门和放线菌门为主要优势门。多样性分析结果显示,冷凝水盘中的细菌群落丰富度和多样性最高,而风口、过滤网和表冷器3组样本之间的细菌群落组成差异无统计学意义(P>0.05)。功能分析结果显示,空调通风系统中的细菌群落主要表现出化能异养型、需氧化能异养型和尿解型等功能特征。[结论]变形菌门的优势地位表明该门类细菌在空调系统中的适应性较强,可能与其能够在不同环境条件下存活和繁殖有关。多样性分析结果表明冷凝水盘是空调系统中细菌繁殖的一个关键区域。风口、过滤网、表冷器这些部位的环境条件相似,导致细菌群落结构的相似性。功能分析结果表明细菌群落具有较强的能量转化和物质代谢能力,可能在空调系统中参与有机物的分解及氮循环等过程。 展开更多
关键词 16S rRNA测序 医院 集中空调 微生物分布 风险预警
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基于16S rRNA测序的2型糖尿病db/db小鼠模型口腔菌群差异分析 认领 引用 被引量：1
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作者 潘钱家 葛峻沂 +2 位作者 胡楠 华飞 顾敏 《实验动物与比较医学》 CAS 2025年第2期147-157,共11页
目的研究db/db小鼠口腔菌群的改变,为探寻2型糖尿病与口腔微生态的联系提供实验基础。方法选取8只10周龄雄性db/db小鼠为糖尿病实验组,8只10周龄雄性db/m小鼠为正常对照组。适应性喂养5 d后,在相同饲料饲养的第6天和第37天行尾静脉采血... 目的研究db/db小鼠口腔菌群的改变,为探寻2型糖尿病与口腔微生态的联系提供实验基础。方法选取8只10周龄雄性db/db小鼠为糖尿病实验组,8只10周龄雄性db/m小鼠为正常对照组。适应性喂养5 d后,在相同饲料饲养的第6天和第37天行尾静脉采血,测定两组小鼠的空腹血糖(fasting blood glucose,FBG)水平和口服葡萄糖耐量(oral glucose tolerance test,OGTT),以验证糖尿病模型的可靠性。在相同饲料饲养的第15天采集两组小鼠两侧颊黏膜、舌背与舌腹、口底黏膜、上腭硬区黏膜、上下颌牙龈的龈上区域的口腔菌群样本,提取口腔微生物的基因组DNA后,使用GeneAmp 9700热循环仪对其中16S核糖体RNA(16S ribosomal RNA,16S rRNA)基因的V3~V4区进行扩增,然后在Illumina MiSeq平台上通过双标引扩增和测序对口腔菌群结构进行评估,然后应用QIIME(version 1.6.0)软件进行生物信息学分析。结果实验开始后第6天和第37天的FBG水平和OGTT检测结果均显示db/db小鼠比db/m小鼠表现出明显的2型糖尿病症状。α多样性分析显示两组小鼠的口腔菌群在多样性上无显著差异(P>0.05),而在丰富度上差异显著(P<0.05)。主坐标分析显示db/db小鼠的口腔菌群结构与db/m小鼠存在显著差异(P<0.05),物种组成分析以及LEfSe分析显示db/db小鼠口腔菌群在门水平以变形菌门(p_Proteobacteria)为主的相对丰度显著上升(P<0.05),而在属水平上变形杆菌属(g_Proteus)和肠球菌属(g_Enterococcus)的相对丰度极显著上升(P<0.001)。结论2型糖尿病db/db小鼠的口腔菌群结构和丰富度均较血糖正常的对照小鼠出现了显著变化。 展开更多
关键词 2型糖尿病 db/db小鼠 口腔菌群 16S rRNA测序
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16s rRNA测序技术检测复方地黄颗粒作用下肺炎链球菌诱导肺炎模型大鼠肠道菌群的变化及其意义 认领 引用
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作者 张雨涵 孔令娟 +1 位作者 柳金英 郭建恩 《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2025年第6期1551-1560,共10页
目的:通过16s rRNA测序技术探讨复方地黄颗粒对肺炎链球菌(Spn)诱导肺炎模型大鼠肠道菌群的影响,并阐明其潜在机制。方法:将30只大鼠随机分为对照组(正常大鼠)、模型组(Spn诱导肺炎大鼠模型)、低剂量复方地黄颗粒组(肺炎大鼠模型灌胃1.7... 目的:通过16s rRNA测序技术探讨复方地黄颗粒对肺炎链球菌(Spn)诱导肺炎模型大鼠肠道菌群的影响,并阐明其潜在机制。方法:将30只大鼠随机分为对照组(正常大鼠)、模型组(Spn诱导肺炎大鼠模型)、低剂量复方地黄颗粒组(肺炎大鼠模型灌胃1.75 g·kg-1复方地黄颗粒)、中剂量复方地黄颗粒组(肺炎大鼠模型灌胃3.50 g·kg-1复方地黄颗粒)和高剂量复方地黄颗粒组(肺炎大鼠模型灌胃7.00 g·kg-1复方地黄颗粒),每组6只。测定大鼠肺组织湿/干重(W/D)比值并分析血气指标,HE染色观察各组大鼠肺组织病理形态表现并评估肺组织损伤程度,试剂盒检测各组大鼠肺泡灌洗液(BALF)中细菌负荷水平和白细胞介素(IL)-6、IL-8及IL-10水平,进行16s rRNA肠道菌群测序分析。结果:与对照组比较,模型组大鼠动脉血二氧化碳分压(PaCO2)明显升高(P<0.05),动脉血氧分压(PaO2)和血氧饱和度(SaO2)明显降低(P<0.05);与模型组比较,低、中和高剂量复方地黄颗粒组大鼠PaCO2明显降低(P<0.05),PaO2和SaO2明显升高(P<0.05),并呈剂量依赖性。HE染色,对照组大鼠肺组织未见明显损伤;模型组大鼠肺组织细胞排列紊乱,大量炎性细胞浸润,肺泡壁毛细血管明显扩张;与模型组比较,低、中和高剂量复方地黄颗粒组大鼠肺组织形态损伤均有所改善。与对照组比较,模型组大鼠肺组织W/D比值和病理评分明显升高(P<0.05);与模型组比较,低、中和高剂量复方地黄颗粒组大鼠肺组织W/D比值和病理评分明显降低(P<0.05),并呈剂量依赖性。与对照组比较,模型组大鼠BALF中细菌负荷水平明显升高(P<0.05);与模型组比较,低、中和高剂量复方地黄颗粒组大鼠BALF中细菌负荷水平明显降低(P<0.05),并呈剂量依赖性。与对照组比较,模型组大鼠BALF中IL-6和IL-8水平明显升高(P<0.05),IL-10水平明显降低(P<0.05);与模型组比较,低、中和高剂量复方地黄颗粒组大鼠BALF中IL-6和IL-8水平明显降低(P<0.05),IL-10水平明显升高(P<0.05),并呈剂量依赖性。与对照组比较,模型组大鼠菌群丰度指标(Chao1)、菌群多样性和均匀性指标(Shannon)、菌群优势度指标(Simpson)及实际检测物种数指标(Observed_species)均明显降低(P<0.05);与模型组比较,低、中和高剂量复方地黄颗粒组大鼠Chao1、Shannon、Simpson和Observed_species均明显升高(P<0.05),并呈剂量依赖性。与对照组比较,模型组大鼠拟杆菌门(Bacteroidetes)相对丰度降低,厚壁菌门(Firmicutes)相对丰度升高,Firmicutes/Bacteroidetes比值明显升高(P<0.05);与模型组比较,低、中和高剂量复方地黄颗粒组大鼠Bacteroidetes相对丰度升高,Firmicutes相对丰度降低,Firmicutes/Bacteroidetes比值明显降低(P<0.05),并呈剂量依赖性。在科水平上,与对照组比较,模型组大鼠棒状杆菌科(Corynebacteriaceae)、葡萄球菌科(Staphylococcaceae)和莫拉氏菌科(Moraxellaceae)相对丰度明显升高,而乳酸杆菌科(Lactobacillaceae)、毛螺菌科(Lachnospiraceae)和嗜黏蛋白阿克曼菌科(Akkermansiaceae)相对丰度明显降低;与模型组比较,低、中和高剂量复方地黄颗粒组大鼠Corynebacteriaceae、Staphylococcaceae和Moraxellaceae相对丰度明显降低,Lactobacillaceae、Lachnospiraceae和Akkermansiaceae相对丰度明显升高。在属水平上,与对照组比较,模型组大鼠脱硫弧菌属(Desulfovibrio)和费克蓝姆氏菌属(Facklamia)相对丰度明显升高,双歧杆菌(Bifidobacterium)和瘤胃球菌属(Ruminococcaceae)相对丰度明显降低;与模型组比较,低、中和高剂量复方地黄颗粒组大鼠Desulfovibrio和Facklamia相对丰度明显降低,Bifidobacterium和Ruminococcaceae相对丰度明显升高。结论:复方地黄颗粒可以改善Spn诱导的肺炎大鼠的炎症和肺损伤,这可能与肠道菌群丰度和多样性的增加有关。 展开更多
关键词 肺炎 16s rRNA测序技术 复方地黄颗粒 肺炎链球菌 肠道菌群
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基于16S rRNA测序探讨木犀草素致骨折大鼠肠道菌群变化 认领 引用
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作者 郑丽 王慧 +5 位作者 丁一桁 郑书深 席少华 郑龙 郝艳娜 薛军霞 《中南药学》 CAS 2025年第12期3551-3556,共6页
目的 探究木犀草素对骨折大鼠肠道菌群的调节作用。方法 建立大鼠胫骨骨折模型,通过影像学评估骨折愈合情况,采用16S rRNA测序分析肠道菌群组成。结果 Garrett评分结果显示,与对照组相比,模型组骨折愈合评分显著降低(P<0.05);而与模... 目的 探究木犀草素对骨折大鼠肠道菌群的调节作用。方法 建立大鼠胫骨骨折模型,通过影像学评估骨折愈合情况,采用16S rRNA测序分析肠道菌群组成。结果 Garrett评分结果显示,与对照组相比,模型组骨折愈合评分显著降低(P<0.05);而与模型组相比,木犀草素组评分显著提高(P<0.05)。线性判别分析效应量(LEfSe)结果显示,对照组和木犀草素组粪球菌属(Coprococcus)明显富集,模型组无显著富集。METASTATS分析显示:粪球菌属及其分类单元(毛螺菌科、梭菌纲、厚壁菌门)分布趋势一致;与对照组相比,模型组中放线菌门相对丰度有增多趋势,红蝽菌目、微球菌科、阿德勒克吕兹菌属及罗氏菌属相对丰度明显升高(P<0.01),木犀草素干预后上述菌属相对丰度显著降低(P<0.05)。结论 木犀草素可能通过调节肠道菌群促进骨折愈合。 展开更多
关键词 木犀草素 16S rRNA测序 骨折 肠道菌群
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基于16S rRNA测序的制药生产环境微生物菌种分布特征研究 认领 引用 被引量：1
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作者 姚瑛 宣泽 +2 位作者 王霞 张光华 江志杰 《中国医药工业杂志》 EI CAS CSCD 2025年第8期1077-1085,共9页
药品生产环境微生物污染控制是保障药品质量安全的关键。该研究利用16S rRNA测序技术,分析来源于制药企业空调系统(42株)、设备表面(11株)、人员工作服(25株)和水系统(20株)的共98株微生物样本的群落分布特征。结果显示,不同来源的微生... 药品生产环境微生物污染控制是保障药品质量安全的关键。该研究利用16S rRNA测序技术,分析来源于制药企业空调系统(42株)、设备表面(11株)、人员工作服(25株)和水系统(20株)的共98株微生物样本的群落分布特征。结果显示,不同来源的微生物群落结构差异显著:空调系统以放线菌纲、芽孢杆菌纲和γ-变形菌纲为主;人员和设备样本中芽孢杆菌纲和放线菌纲占优;水系统以α-、β-和γ-变形菌纲为主,且与其他环境无交叉分布。跨环境同源菌株分析结果显示,空调、设备和人员环境中存在共有菌株,提示空气流动、人员接触及设备表面是此类菌株的潜在传播途径。建议制药企业建立环境菌种库,结合动态监测结果和系统进化分析,以实现环境微生物风险的精准防控。 展开更多
关键词 环境微生物学 污染控制 16S rRNA测序 系统发育树 微生物溯源
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基于16S rRNA测序和代谢组学探讨新金汁对热秘型便秘大鼠肠道菌群的调控机制 认领 引用 被引量：1
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作者 郭智月 谢懿煊 +4 位作者 刘双 谭书法 黄灵 李玉玮 许晨 《中国中西医结合外科杂志》 CAS 2025年第5期650-656,共7页
目的:基于16S rRNA测序及非靶向代谢组学技术,分析肠道菌群的变化及肠道代谢物的富集通路,探讨新金汁(粪菌移植)对热秘型便秘大鼠的治疗机制。方法:将32只雌性Wistar大鼠适应性喂养1周后,随机均分为模型组、粪菌移植组、乳果糖组和空白... 目的:基于16S rRNA测序及非靶向代谢组学技术,分析肠道菌群的变化及肠道代谢物的富集通路,探讨新金汁(粪菌移植)对热秘型便秘大鼠的治疗机制。方法:将32只雌性Wistar大鼠适应性喂养1周后,随机均分为模型组、粪菌移植组、乳果糖组和空白组,粪菌移植组先通过抗生素鸡尾酒法(杆菌肽、新霉素和链霉素混合)处理为假无菌大鼠,之后粪菌移植组、乳果糖组与模型组同时给予热性中药(黑附片、干姜、吴茱萸、肉桂、胡椒,生药剂量为20 g/kg)联合盐酸洛哌丁胺(2 mg/kg,)连续给药2周,建立热秘型便秘大鼠模型后进行干预,乳果糖组作为阳性对照组,灌胃10 mL/kg乳果糖,粪菌移植组灌胃10 mL/kg粪菌液,均干预2周。计算并比较四组大鼠的粪便含水率和肠道炭末推进率,采用16S rRNA测序检测模型组、粪菌移植组和空白组粪便标本肠道菌群特征及肠道代谢物的富集通路分析。结果:与空白组相比,模型组大鼠的粪便含水率和肠道炭末推进率降低;与模型组相比,粪菌移植组和乳果糖组粪便含水率和肠道炭末推进率明显升高,差异有统计学意义。与空白组相比,模型组的拟杆菌门(Bacteroidota)丰度降低,条件致病菌变形菌目(Proteobacteria)异常增殖。粪菌移植干预后菌群均匀度指数与厚壁菌门/拟杆菌门(Firmicutes/Bacteroidota)比例趋近空白组水平。线性判别分析(LEfSe)显示粪菌移植组优势菌群主要是普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)和理肯氏菌科(Rikenellaceae)。代谢组学揭示粪菌移植能显著富集脂质代谢、能量代谢、氨基酸代谢等核心代谢通路。结论:新金汁通过重塑肠道菌群多样性,平衡肠道菌群结构,激活菌群代谢功能,重构肠道微生物稳态,从而有效缓解热秘型便秘。 展开更多
关键词 热秘型便秘 新金汁 粪菌移植 16S rRNA测序 非靶向代谢组学 肠道微生态
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抗无乳链球菌罗非鱼及其杂交后代的鳃和尾鳍组织细菌16S rRNA测序分析 认领 引用
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作者 刘奕 吴昊天 +3 位作者 陈丽婷 严欣 肖俊 陆颖 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2025年第6期1813-1822,共10页
【目的】探究抗无乳链球菌良种壮罗1号罗非鱼抗病机制与细菌群落的关系及其在杂交后代中的遗传效应,为通过杂交育种选育兼具快速生长和抗病性状的罗非鱼提供理论依据。【方法】以吉富罗非鱼和壮罗1号罗非鱼为亲本进行自交和杂交,获得吉... 【目的】探究抗无乳链球菌良种壮罗1号罗非鱼抗病机制与细菌群落的关系及其在杂交后代中的遗传效应,为通过杂交育种选育兼具快速生长和抗病性状的罗非鱼提供理论依据。【方法】以吉富罗非鱼和壮罗1号罗非鱼为亲本进行自交和杂交,获得吉富自交F1代、壮罗1号自交F1代、吉富×壮罗1号杂交F1代、壮罗1号×吉富杂交F1代。采集4组罗非鱼的鳃和尾鳍组织,对16S rRNA的V3~V4区进行测序,分析不同样本细菌群落结构,采用基于线性判别分析的效应大小分析(LEfSe)筛选不同样本细菌群落间具有显著差异的生物标志物。【结果】Alpha多样性分析结果表明,壮罗1号自交F1代鳃和尾鳍细菌群落的Shannon指数、Shannon even指数和Simpson指数均明显小于吉富自交F1代。壮罗1号×吉富杂交F1代和吉富×壮罗1号杂交F1代的细菌群落多样性也整体较吉富自交F1代明显下降。Beta多样性分析结果表明,壮罗1号×吉富杂交F1代、吉富×壮罗1号杂交F1代的鳃和尾鳍细菌群落组成较接近壮罗1号自交F1代,说明壮罗1号的细菌群落结构具有较好的遗传可继承性。壮罗1号自交F1代、壮罗1号×吉富杂交F1代、吉富×壮罗1号杂交F1代鳃和尾鳍细菌群落中,好氧或兼性厌氧菌栖水菌属(Enhydrobacter)的相对丰度明显高于吉富自交F1代。壮罗1号自交F1代鳃细菌群落中筛选到的生物标志物包含嗜酸菌2013Ark19i。【结论】壮罗1号罗非鱼鳃细菌群落中存在相对丰度较高的需氧菌和嗜酸菌,表明鳃黏液形成了酸性环境,不利于无乳链球菌生长,而需氧菌能通过竞争性耗氧抑制无乳链球菌生长,推测壮罗1号罗非鱼的抗病机制与其细菌群落密切相关,且其细菌群落结构具有可遗传性,使杂交后代具有接近壮罗1号罗非鱼的抗病能力。 展开更多
关键词 罗非鱼 无乳链球菌 细菌群落 抗病 16S rRNA测序
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